Сайты крайне полезные при планировании поездки

http://www.hyperdia.com/ - вводим откуда и куда едем (если необходимо то где конкретно хотимсделать пересадку), дату и время отправления (прибытия) и получаемрассчет маршрюта с ценами и временем. Правда цены даны стандартные безвозможных скидок и акций.

http://www.jorudan.co.jp/english/ - примерно то же

http://www.jambus.jp/
http://www.bus.or.jp/bus/
http://www.kakuyasubus.jp/

Междугородние автобусы.

http://www.travel.co.jp/air/
http://world.kokuken.net/

Поиск дешевых билетов на самолет.

http://www.starflyer.jp/index.html

Весьма недорогая авиакомпания. Правда мало наравлений.